Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms