Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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