Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms