Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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