Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DffaO54786 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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