Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nek2O35942 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nek2O35942 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nek2O35942 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms