Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pkd2O35245 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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