Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3278L7N2D2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms