Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms