Protein–RNA interactions for Protein: J3QPN2

Gm21870, Predicted gene, 21870, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21870J3QPN2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21870J3QPN2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms