Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms