Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms