Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34aG3UW52 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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