Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms