Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rab3gap1-201ENSMUST00000037649 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ggt5-201ENSMUST00000072217 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Cyp2c44-201ENSMUST00000026211 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Panx3-201ENSMUST00000011262 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm16130-201ENSMUST00000153106 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Mark3-206ENSMUST00000221459 2807 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Trpm1-202ENSMUST00000177102 2928 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Txndc16-201ENSMUST00000022377 4028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Atg13-201ENSMUST00000028678 3604 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Plekho2-201ENSMUST00000068944 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Slc2a9-201ENSMUST00000005238 3243 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gpn1-201ENSMUST00000076949 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 A230059L01Rik-201ENSMUST00000126596 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gpr183-201ENSMUST00000049872 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 4930571K23Rik-201ENSMUST00000166958 2153 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Klhl10-201ENSMUST00000001599 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms