Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm10378F6XQQ1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm10378F6XQQ1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms