Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms