Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Myo5cE9Q1F5 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Myo5cE9Q1F5 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Myo5cE9Q1F5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Myo5cE9Q1F5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Myo5cE9Q1F5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Myo5cE9Q1F5 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Myo5cE9Q1F5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms