Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
FgaE9PV24 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
FgaE9PV24 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
FgaE9PV24 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
FgaE9PV24 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FgaE9PV24 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms