Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Phf11bB4XVQ1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.2 ms