Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms