Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Tmem235B1AQL3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem235B1AQL3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem235B1AQL3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Tmem235B1AQL3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms