Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms