Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms