Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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