Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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