Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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