Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Phf1Q9Z1B8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf1Q9Z1B8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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