Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

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Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Vav3Q9R0C8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vav3Q9R0C8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vav3Q9R0C8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vav3Q9R0C8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vav3Q9R0C8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vav3Q9R0C8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vav3Q9R0C8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vav3Q9R0C8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vav3Q9R0C8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vav3Q9R0C8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms