Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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