Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms