Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms