Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr5Q9JLF7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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