Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gde1Q9JL56 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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