Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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