Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms