Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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