Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms