Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms