Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms