Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chmp5Q9D7S9 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp5Q9D7S9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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