Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms