Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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