Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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