Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Utp23Q9CX11 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms