Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms