Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rnaseh2cQ9CQ18 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnaseh2cQ9CQ18 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnaseh2cQ9CQ18 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnaseh2cQ9CQ18 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnaseh2cQ9CQ18 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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