Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms