Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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