Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Snx15Q91WE1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Snx15Q91WE1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Snx15Q91WE1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Snx15Q91WE1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Snx15Q91WE1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx15Q91WE1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms